深圳中港物流公司的業務主要是深圳到香港貨物運輸，所以常走的陸路跨境口岸主要是位于深圳與香港交接的5個陸運貨運口岸（深圳灣口岸、皇崗口岸、文錦渡口岸、沙頭角口岸、蓮塘口岸）。

1、深圳灣口岸

現時通關時間： 24小時

位于深圳市南山區蛇口東角頭,經深圳灣跨海大橋連接香港鰲勘石。從2007年口岸開始運行，口岸設計通過能力為每日車輛5.86萬輛(其中貨車4.32萬輛次、小汽車1.39萬輛次、大客車1500輛次),設計旅客流量為每天6萬人次。

2、文錦渡口岸

現時通關時間：7：00-22：00

位于深圳市羅湖區南面、香港新界北面,由一座公路橋與香港新界相連。是以供港鮮活產品及進口水果通關為特點的客、貨運綜合性公路口岸。深圳中港物流公司走生鮮類貨物，都是會選擇文錦渡口岸。每日7時開閘,22時關閘,運行15小時。

3、蓮塘口岸

通關時間：7：00-22：00

位于深圳市羅湖區蓮塘街道，承擔著香港與深圳東部、惠州、粵東、贛南、閩南等地之間的跨境客貨運任務，是構筑深港跨境交通“東進東出、西進西出”重大格局的東部重要口岸。

蓮塘口岸日通關能力3萬人次，通關時間可縮至10秒。目前，旗下的深港過境貨車有走蓮塘口岸，體驗到了高速通關效率。

4、沙頭角口岸

通關時間：7：00-22：00

位于深圳市鹽田區沙頭角西面,東接沙頭角保稅區和鹽田港,北鄰梧桐山公路隧道，是服務于深圳市鹽田、龍崗及珠江三角洲東部地區的輔助性客貨綜合性口岸。旅檢大廳設在口岸區中間,東側是出境貨檢場,西側是入境貨檢場，共設有出入境車輛檢查通道10條(出入境各5條),查車臺15 個。設計通過能力每日車輛1500 輛次、人員1500人次。

5、皇港口岸

通關時間： 24小時

位于深圳市福田區南端,與香港新界落馬洲隔河相望,口岸南面的皇崗—落馬洲大橋橫跨深圳河連接深港兩地。

目前皇崗口岸在重建，新口岸建成將成為一個純旅檢口岸，取消貨檢功能，到時陪伴深圳中港物流公司幾十年的跨境口岸可能就要與我們的貨車告別了。雖然有很多的不舍，但是歷經30年風雨的老皇崗口岸早已滿足不了現在通關效率和查驗模式的需求，此次重建可以大大緩解皇崗堵車、深夜鳴笛等擾民的不良影響，為兩地居民生活提供更好的福祉。